ISSN 1728-2985
ISSN 2414-9020 Online

Evaluation of the composition of the microbiota of the urethra in men with sexually transmitted infections

M.R. Rakhmatulina, M.N. Boldyreva, E.V. Lipova, A.S. Chekmarev, I.S. Galkina

1) State Research Center «Institute of immunology» of Federal Medical Biological Agency, Moscow, Russia; 2) Company DNA-Technology LLC, Moscow, Russia
Objective: to conduct a comparative study of the composition of the microbiota of the urethra in men with sexually transmitted infections (STIs), and healthy men. Material and methods. The study included 103 men aged 18 to 45 years: 42 men with urethritis caused by STIs and 61 clinically healthy men. Identification of pathogenic and conditionally pathogenic microorganisms in scrapings from the urethra was performed by PCR in real time (test system Androflor® (DNA-Technology, Moscow). Results. In the analysis of the total bacterial mass, it was found that the bacterial contamination of the urethral biotope in patients with STI was significantly higher than in the group of healthy men (5.8 Lg10 and 4.7 Lg10, respectively), with the highest level of bacterial contamination was detected in patients infected with N. gonorrhoeae (6.4 Lg10). Patients with STIs had significantly lower levels of relative Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Corynebacterium spp. and their amounts in General compared to clinically healthy men: according to ROC analysis, the best diagnostic indicator (0.93±0.04, p<0.001), distinguishing a group of healthy individuals from patients with STI, was the amount of Staphylococcus spp., Streptococcus spp. and Corynebacterium spp. («Amount Of Normoflor»). In patients infected with C. trachomatis, compared with clinically healthy men, the relative number was significantly higher of Bacteroides spp. / Porphyromonas spp. / Prevotella spp., Peptostreptococcus spp. / Parvimonas spp.; in patients infected with N. gonorrhoeae – Anaerococcus spp. and in patients infected with M. genitalium – Megasphaera spp. / Veillonella spp. / Dialister spp., Anaerococcus spp., Peptostreptococcus spp. / Parvimonas spp. and Eubacterium spp. Conclusion. An increase in the total bacterial contamination of the urethra in STI was found, most pronounced in infection with Neisseria gonorrhoeae. The best diagnostic indicator that distinguishes normal microbiota from the microbiota of patients with STIs is the sum of Staphylococcus spp., Streptococcus spp. and Corynebacterium spp. In patients with clinical signs of an inflammatory reaction and the presence of STIs, a decrease in the normoflora in all types of STIs and an increase in obligate anaerobic bacteria – Megasphaera spp. / Veillonella spp. / Dialister spp., Bacteroides spp. / Porphyromonas spp. / Prevotella spp., Anaerococcus spp., Peptostreptococcus spp. / Parvimonas spp. and Eubacterium spp.

Keywords

STI
urethritis
urethral microbiota
real-time PCR

Введение. Инфекционно-воспалительные заболевания мочеполовой системы являются одной из причин нарушения репродуктивной функции и снижения качества жизни пациентов. Повреждение тканей на фоне инфекционного процесса может происходить как в результате прямого воздействия микроорганизмов, так и опосредованным путем вследствие воспалительной реакции в ответ на инфицирование патогенными микроорганизмами или на массивную колонизацию эндогенными условно-патогенными микроорганизмами.

Одним из наиболее распространенных заболеваний мочеполового тракта у мужчин является уретрит. Несмотря на то что известны и неинфекционные причины возникновения уретрита, большинство случаев данной патологии имеет инфекционную природу, при этом частыми этиологическими агентами заболевания группы возбудителей инфекций, передаваемых половым путем (ИППП), являются Neisseria gonorrhoeae и Chlamydia trachomatis. Развитие нехламидийных негонококковых уретритов может быть также обусловлено Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum, Trichomonas vaginalis, реже – вирусами простого герпеса или аденовирусами [1–3]. В отсутствие возбудителей ИППП наиболее вероятной этиологической причиной уретритов у мужчин являются микроорганизмы, вызывающие заболевания репродуктивного тракта у женщин, а также представители анаэробной микрофлоры [3–6].

До недавнего времени гипотезы о возможных инфекционных возбудителях заболеваний мочеполовой системы могли быть подтверждены только результатами культуральных исследований, что ограничивало идентификацию значительного числа микроорганизмов. Однако в последние годы в результате активного внедрения в практическую медицину молекулярно-биологических методов исследования спектр микроорганизмов – потенциальных этиологически значимых участников патологических процессов в урогенитальном тракте был значительно расширен благодаря идентификации труднокультивируемых или неподдающихся культивированию микроорганизмов [7, 8].

Попытки изучения состава микрофлоры мужской уретры у пациентов с ИППП и поиск доказательств гипотезы о зависимости восприимчивости к инфекциям от состава биоты мужской уретры предпринимались ранее с помощью бактериологических методов. Однако результаты данных исследований часто являлись противоречивыми. Так, при культивировании микроорганизмов из уретральных соскобов, полученных от здоровых мужчин и мужчин с хламидийным и нехламидийным негонококковым уретритом, были выделены разные популяции бактерий [9].

Применение высокотехнологичного метода масс-спектрометрии позволило расширить представления о видовой идентификации условно-патогенных микроорганизмов и увеличить спектр ее выявления на 43,5%. При исследовании микробного спектра урогенитального тракта больных уретритом методом масс-спектрометрии было установлено, что наиболее часто из условно-патогенных микроорганизмов выделялись грамположительные, факультативно-анаэробные микроорганизмы рода Staphylococcus (74,4%), Streptococcus (52,7%), Enterococcus (15,7%), микроорганизмы семейства Enterobacteriaceae (11,5%) в умеренных и высоких диагностических титрах. При этом спектр идентифицируемых видов Streptococcus, Staphylococcus, Corynebacterium, неферментирующих грамотрицательных палочек с применением высокотехнологичного метода MALDI TOF MS был увеличен в 2,2 раза по сравнению с классическим бактериологическим исследованием [10].

В последние годы идет активное развитие некультуральных молекулярно-биологических методов, основанных на анализе нуклеиновых кислот микроорганизмов, что позволяет получать новые данные о составе микрофлоры половых путей при различной патологии. Так, в работе [4] исследование 16S rРНК микроорганизмов позволило выявить существенные различия микробных сообществ у мужчин с уретритом по сравнению со здоровыми мужчинами.

Одной из современных технологий идентификации микроорганизмов является полимеразная цепная реакция с регистрацией результатов в режиме реального времени (ПЦР-РВ) – метод, обеспечивающий возможность количественной оценки любого необходимого спектра инфекционных агентов в биологической пробе. Комбинация высокой чувствительности и специфичности, низкий риск контаминации, скорость получения результата исследования (1–1,5 ч), возможность количественного анализа и идентификации некультивируемых микроорганизмов делают технологию ПЦР-РВ высоковостребованной для диагностики урогенитальных инфекций.

Цель исследования: провести сравнительное изучение состава микробиоты уретры у мужчин с уретритами, вызванными ИППП, и здоровых мужчин.

Материалы и методы. В исследование были включены 103 мужчины в возрасте от 18 до 45 лет, разделенных на 2 группы. В группу исследования вошли 42 мужчины, обратившихся в медицинские организации с жалобами со стороны мочеполового тракта. У пациентов данной группы были выявлены объективные симптомы уретрита, подтвержденные наличием лейкоцитарной реакции в мазках, окрашенных по Граму, а также один или нескольких облигатных патогенов (T. vaginalis, N. gonorrhoeae, C. trachomatis, M. genitalium), идентифицированных методом ПЦР.

Группу сравнения составил 61 мужчина, не имевший субъективных и объективных признаков инфекционно-воспалительного процесса мочеполового тракта и не инфицированный возбудителями ИППП.

Критериями включения в группу сравнения являлись:

  • отсутствие субъективных и объективных симптомов заболевания мочеполовой системы;
  • наличие в отделяемом уретры не более 5 полиморфно-ядерных лейкоцитов в поле зрения при просмотре более 5 полей зрения при увеличении светового микроскопа 1000;
  • отсутствие облигатных патогенов (T. vaginalis, N. gonorrhoeae, C. trachomatis, M. genitalium), подтвержденное результатами ПЦР;
  • отсутствие приема антибактериальных и антианаэробных лекарственных препаратов в течение 1 мес. до настоящего исследования;
  • отсутствие применения местнодействующих лекарственных препаратов (антисептических, антибактериальных и т.д.) в течение 2 нед. до настоящего исследования;
  • отсутствие незащищенных половых контактов в течение 3 дней до настоящего исследования.

Критерием исключения из группы сравнения являлось наличие заболеваний, способных влиять на результаты исследования (сахарный диабет, дерматозы аногенитальной локализации, онкологические заболевания, иммунодефицитные состояния).

С целью идентификации патогенных и условно-патогенных микроорганизмов всем пациентам было выполнено исследование соскобов из уретры методом ПЦР-РВ (ДТ-Prime, тест-система Андрофлор® [ДНК-Технология, Москва]), при этом оценивали следующие показатели: общую бактериальную массу (ОБМ), геномную ДНК человека (ГДЧ), Lactobacillus spp, Staphylococcus spp, Streptococcus spp, Corynebacterium spp., Gardnerella vaginalis, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Atopobium cluster, Megasphaera spp./Veillonella spp./Dialister spp., Sneathia spp./Leptotriсhia spp./Fusobacterium spp., Bacteroides spp./Рorphyromonas spp./Prevotella spp., Anaerococcus spp., Eubacterium spp., Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp., Pseudomonas aeruginosa/Ralstonia spp./Burkholderia spp., Haemophilus spp., Enterobacteriaceae spp./Enterococcus spp., Candida spp., T. vaginalis, N. gonorrhoeae, C. trachomatis, M. genitalium.

Показатель «Сумма Нормофлора» включил Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Corynebacterium spp. относительно ОБМ; показатель «Сумма Бактериальный вагиноз — ассоциированные бактерии (БВ–АБ)»: G. vaginalis, M. hominis, U. urealyticum, U. parvum, Atopobium cluster, Megasphaera spp./Veillonella spp. /Dialister spp., Sneathia spp./Leptotrichia spp./Fusobacterium spp.; показатель «сумма Анаэробы» – Bacteroides spp./Porphyromonas spp./Prevotella spp., Anaerococcus spp., Eubacterium spp.

Исследование мочи не выполняли, так как это не входило в задачи исследования.

Расчет общей бактериальной обсемененности уретрального биотопа, а также абсолютных количеств микроорганизмов в геномных эквивалентах (ГЭ) проводили с помощью программного обеспечения к прибору, используя математическую формулу, учитывающую номер порогового цикла при проведении ПЦР-РВ. Относительные числа микроорганизма/группы микроорганизмов ПО рассчитывали в виде разницы абсолютных значений Lg10 микроорганизма/группы микроорганизмов и ОБМ по формуле ОК=Lg10Х-Lg10(ОБМ), где ОК – относительное число, Х – показатель (микроорганизм/группа микроорганизмов).

Статистическую обработку результатов и построение ROC-кривой проводили с использованием пакета статистических программ SPSS (SPSS Inc., США). Для описания состава микробиоты вычисляли медиану абсолютных и относительных количеств микроорганизмов/групп микроорганизмов. В качестве меры дисперсии использовали верхний и нижний квартили. Сравнение групп проводили с использованием непараметрической статистики (тест Мани–Уитни).

Результаты. При анализе анамнестических данных было установлено, что субъективные симптомы уретрита у 20 (47,6%) мужчин наблюдались в течение 2–7 дней, у 22 (52,4%) – в течение 7–14 дней. Основными субъективными симптомами являлись зуд, жжение в области уретры (38; 90,5%), болезненность при мочеиспускании (29; 69%), дискомфорт в области уретры (10; 23,8%), учащенное мочеиспускание (8; 19%), патологические (гнойные, слизисто-гнойные) выделения из уретры (38; 90,5%). При осмотре у всех пациентов группы исследования были выявлены объективные симптомы уретрита – гиперемия и отечность слизистой оболочки наружного отверстия мочеиспускательного канала (38; 90,5%) и/или инфильтрация стенок уретры (29; 69%) и/или патологические (гнойные, слизисто-гнойные) выделения из уретры (38; 90,5%).

По результатам микроскопического исследования уретральных мазков, окрашенных метиленовым синим и по Граму, у 11 (26,2%) пациентов группы исследования было выявлено от 5 до 10 полиморфно-ядерных лейкоцитов в поле зрения, у 14 (33,3 %) – от 10 до 20, у 17 (40,5%) – более 20.

Согласно результатам обследования на ИППП у пациентов группы исследования были идентифицированы C. trachomatis (26; 61,9 %), M. genitalium (10; 23,8 %), N. gonorrhoeae (5; 11,9 %) и T. vaginalis (1; 2,3 %).

При анализе показателей ОБМ было установлено, что бактериальная обсемененность уретрального биотопа у пациентов с ИППП была существенно выше, чем в группе сравнения (5,8 и 4,7 Lg10 соответственно), при этом у 6 (9,8%) человек из группы здоровых мужчин данный показатель был ниже порогового значения 4,0 Lg10. Самый высокий уровень бактериальной обсемененности был выявлен у пациентов, инфицированных N. gonorrhoeae (6,4 Lg10); при идентификации C. trachomatis, M. genitalium и T. vaginalis показатели ОБМ составили 5,7 Lg10, 5,5 и 6,1 Lg10 соответственно (табл. 1).

При детальном изучении уретрального биотопа было установлено отсутствие достоверных различий по абсолютным значениям показателей условно-патогенных генитальных микоплазм (U. urealiticum, U. parvum, M. hominis) и Candida spp. у пациентов, инфицированных ИППП, и пациентов группы сравнения. Также не было выявлено значимых различий по относительным значениям следующих показателей: Lactobacillus spp., G. vaginalis, Atopobium cluster, Sneathia spp./Leptotrichia spp./ Fusobacterium spp., Haemophilus spp., Pseudomonas aeruginosa/Ralstonia spp./Burkholderia spp. и Enterobacteriaceae spp./ Enterococcus spp.

Статистически значимо более низкий уровень относительного числа Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Corynebacterium spp. и их суммы был выявлен у пациентов с ИППП в целом, а также у пациентов с C. trachomatis и M. genitalium. У пациентов, инфицированных N. gonorrhoeae, уровень относительного количества Staphylococcus spp., Corynebacterium spp. был ниже, чем в группе сравнения, а относительный уровень Streptococcus spp. статистически значимо не отличался от группы клинически здоровых мужчин.

У пациентов с ИППП в целом по сравнению с группой сравнения было выявлено увеличение относительного числа следующих облигатно-анаэробных условно-патогенных микроорганизмов: Megasphaera spp./Veillonella spp./Dialister spp., Anaerococcus spp., Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp. и Eubacterium spp. При этом у пациентов, инфицированных C. trachomatis, былj значимо выше относительное число Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp., у пациентов, инфицированных M. genitalium, – Megasphaera spp./Veillonella spp./Dialister spp., Anaerococcus spp., Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp. и Eubacterium spp.

У пациентов с N. gonorrhoeae значимых различий с группой сравнения в относительном числе условно-патогенных микроорганизмов выявлено не было (табл. 2).

Для подтверждения предположения о том, будто в большинстве наблюдений Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Corynebacterium spp. относятся к микроорганизмам, преимущественно занимающим основную долю ОБМ у здоровых мужчин, а также для оценки роли показателя «Сумма Нормофлора», был выполнен ROC-анализ, обладающий наибольшей предсказательной ценностью и позволяющий наглядно демонстрировать разницу групп. Самая высокая диагностическая точность (0,93), которая расценивается как отличная, была получена для показателя «Сумма Нормофлора» (см. рисунок, табл. 3).

Обсуждение. В настоящее время данные о составе нормальной уретральной микробиоты у мужчин достаточно ограничены и в большинстве известных исследований получены на маленьких выборках пациентов. Так, в работе Ю. В. Иванова [2] у 33 клинически здоровых мужчин культуральным методом были выявлены Staphylococcus epidermidis, Corynebacterium spp., Lactobacillus, Haemophilus vaginalis, Streptococcus α-haemolyticus. Известно, что среди представителей микробного сообщества эпидермиса преобладают стафилококки, стрептококки и коринебактерии [11], в связи с чем проводились исследования по изучению частоты выявления данных микроорганизмов и из отделяемого мочеполовой системы. Q. Dong et al., а также Fouts D.E. et al. [12, 13] при изучении образцов, полученных из уретры здоровых добровольцев, констатировали преобладание Corynebacterium и сделали заключение, согласно которому эти микроорганизмы могут играть определенную роль в поддержании нормальной уретральной микрофлоры.

Ранее было продемонстрировано, что при негонококковом уретрите наблюдается значительное снижение численных показателей аэробов в микробиоте уретры [12]. Эти данные совпадают с результатами настоящего исследования, в ходе которого установлено, что Staphylococcus являются составной частью нормальной микрофлоры у мужчин и их численные показатели снижаются при инфицировании ИППП, когда безу-словные патогены (а возможно, и условно-патогенные микроорганизмы) замещают представителей нормальной микрофлоры. Нами было показано, что ИППП являлись фактором, заведомо влияющим на состав микробиоты уретры: по сравнению с группой здоровых мужчин у пациентов с ИППП были снижены численные показатели по трем группам бактерий: Staphylococcus, Streptococcus и Corynebacterium, как по отдельности, так и в сумме. ROC-анализ показал, что наилучшим диагностическим показателем, отличающим группу здоровых мужчин от пациентов с ИППП, является сумма указанных групп микроорганизмов (площадь под ROC-кривой 0,93±0,04, p<0,001).

Вывод о возможной взаимосвязи ИППП с условно-патогенными анаэробными микроорганизмами был сделан в работе D. E. Nelson et al. [3]. В настоящем исследовании у пациентов с хламидийной и микоплазменной инфекциями по сравнению со здоровыми лицами также отмечалось увеличение групп некультивируемых и труднокультивируемых анаэробных бактерий (Megasphaera spp./Veilonella spp./Dialister spp., Bacteroides spp./Porphyromonas spp./Prevotella spp., Anaerococcus spp. и Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp.), которые ранее связывали с бактериальным вагинозом у женщин [9, 14, 15]. Таким образом, предположения D. E. Nelson et al. [3] о том, что анаэробные микроорганизмы, ассоциированные с развитием бактериального вагиноза, могут быть связаны с риском заражения ИППП у мужчин, нашли подтверждение и в настоящей работе. Тем не менее результаты исследования, полученные нами, так же как и данных D. E. Nelson о возможной связи анаэробов с развитием ИППП, недостаточно для того, чтобы сделать заключение о том, каким образом ИППП-ассоциированные сообщества микроорганизмов взаимосвязаны с заболеванием: предшествуют ему, передаются совместно с возбудителями ИППП или увеличиваются вследствие ИППП?

Заключение. Сравнительное исследование состава микробиоты уретры у здоровых мужчин в норме и мужчин с ИППП, выполненное методом ПЦР-РВ, продемонстрировало увеличение общей бактериальной обсемененности уретры при ИППП, наиболее выраженное при инфицировании N. gonorrhoeae. Наилучшим диагностическим показателем, отличающим таковые нормальной микробиоты от микробиоты пациентов с ИППП, являлась сумма Staphylococcus spp., Streptococcus spp. и Corynebacterium spp. У пациентов с клиническими признаками воспаления и наличием ИППП установлено снижение нормофлоры при всех видах ИППП и увеличение числа ряда облигатных анаэробных бактерий – Megasphaera spp./Veillonella spp./Dialister spp., Bacteroides spp./Porphyromonas spp./Prevotella spp., Anaerococcus spp., Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp. и Eubacterium spp.

About the Authors

Corresponding author: A.S. Chekmarev – PhD in Medical Sciences, Associate Professor at the Department a dermatovenereology and cosmetology with a course of clinical laboratory diagnostics State Research Center – Burnasyan Federal Medical Biophysical Center of Federal Medical Biological Agency, Moscow, Russia; e-mail: fmba-derma@mail.ru

Similar Articles

By continuing to use our site, you consent to the processing of cookies that ensure the proper functioning of the site.