ISSN 1728-2985
ISSN 2414-9020 Online

Investigation of the role of polymorphic loci RS2299941, RS1903858, RS10490920, RS2735343 of the PTEN gene in patients with prostate cancer

V.N. Pavlov, M.V. Loginova, E.A. Ivanova, A.T. Mustafin, I.R. Gilyazovа

1) FGBOU VO Bashkir State Medical University of the Ministry of Health of the Russian Federation, Ufa, Russia; 2) FGBUN Institute of biochemistry and genetics of Ufa Federal Research center of RAS, Ufa, Russia
Prostate cancer is a clinically heterogeneous disease, and accurate risk stratification of patients is becoming a key clinical task. This is the most common malignant neoplasm and the leading cause of cancer death in men worldwide. Genomic markers include tools and technologies that can predict the probability of an initial positive biopsy, reduce the number of unnecessary repeated biopsies, identify tumors with low, medium and high risk, classify the degree of disease, as well as predict and monitor the clinical response to intervention. Variants of the PTEN gene are of great interest as genetic markers of the risk of developing prostate malignancies.

Keywords

prostate cancer
PTEN gene
single-nucleotide polymorphisms
PSA

Введение. Рак простаты (РП) является гетерогенным и многофакторным заболеванием, которое протекает в виде вялых или крайне агрессивных опухолей и является значимым источником заболеваемости и смертности среди мужского населения. В 2018 г., по оценкам, зарегистрировано 1,3 млн новых случаев и 359 тыс. связанных с ними смертей во всем мире [1, 2].

Простатспецифический антиген (ПСА) является наиболее часто используемым скрининговым биомаркером для диагностики РП и мониторинга развития злокачественного процесса. Однако использование тестирования на ПСА при скрининге РП вызывает споры из-за отсутствия окончательных данных рандомизированных исследований и отсутствия специфичности между доброкачественными и злокачественными новообразованиями. Стратификация на основе традиционных клинических параметров может определять риск развития у пациентов злокачественных новообразований, вероятность прогрессирования рака на ранней стадии заболевания [3].

Наиболее часто используемыми методами прогнозирования РП является классификация TNM, используемая с градацией по шкале Глисона, и определение уровня ПСА [4]. Однако клиническое применение этих показателей ограниченно. Американская урологическая ассоциация поощряет выявление новых генетических маркеров, которые помогут идентифицировать мужчин с повышенным риском развития и прогрессирования заболевания [5].

В исследованиях все чаще выявляется связь однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) с развитием различных заболеваний, в результате чего SNP постепенно используются в качестве маркеров, связанных с раком, в том числе и с РП. Следовательно, SNP привлекают значительное внимание для использования их в качестве прогностических показателей до и после лечения пациентов с РП [6].

За последние десятилетия различные SNP связывают с развитием аденокарциномы простаты. SNP гена PTEN представляют значительный интерес в качестве генетического маркера риска развития злокачественных новообразований простаты.

Ген PTEN представляет собой супрессор опухоли с двойной специфичностью, основным субстратом которого является фосфатидилинозитол(3,4,5)-трисфосфат (PIP3). Белок PTEN действует как антагонист на пути PI3K/AKT, поддерживая низкий уровень PIP3: чем больше концентрация PIP3, тем сильнее сигнализация пути PI3K/AKT, которая провоцирует ингибирование клеточного цикла, миграцию, метастазирование и апоптоз. Вероятность потери функции гена PTEN выше при агрессивном метастатическом заболевании, что предполагает возможность его применения в качестве генетического маркера для прогнозирования течения заболевания и для отличия вялотекущих опухолей от агрессивных форм рака [7, 8, 19].

Среди прогностических биомаркеров ДНК, полученных в результате секвенирования тысяч случаев РП, потеря гена PTEN, возможно, остается одной из наиболее многообещающих [9]. Инактивация PTEN при опухолях простаты связана с неблагоприятными онкологическими исходами, такими как увеличение степени дифференцировки и распространенности онкологического процесса, более ранним биохимическим рецидивом после радикальной простатэктомии, метастазированием, смертью от РП и андроген-независимым прогрессированием заболевания [10–12]. В ранее проведенных исследованиях подтверждена корреляция делеции гена PTEN с увеличением балла Глисона и повышением вероятности экстрапростатического расширения у пациентов с локализованным РП, получивших хирургическое лечение [13]. В нескольких крупных исследованиях подтверждена связь потери PTEN с повышенным риском биохимического рецидива после простатэктомии [10, 14, 15]. Возможно, самое важное, что PTEN оказался независимым прогностическим показателем смерти от РП у пациентов, получавших консервативное или хирургическое лечение [16, 17]. В одном небольшом исследовании потеря PTEN в образце биопсии предсказала повышенный риск кастрационно-резистентного РП, метастазирования и смертности среди пациентов, получавших хирургическое лечение [18].

Принимая во внимание связь между потерей PTEN и увеличением балла Глисона, ген PTEN может быть полезным в качестве прогностического маркера при локализованном РП. Широкое внедрение новых генетических маркеров позволит обнаружить различные заболевания до появления клинических проявлений, тем самым позволит предоставлять дополнительную и независимую информацию о возможных рисках, клиническом течении, прогнозе и предполагаемом исходе.

Цель исследования – оценка роли полиморфных локусов rs2299941, rs1903858, rs10490920,rs2735343 гена PTEN у пациентов с раком простаты в качестве возможных молекулярно-генетических маркеров риска развития заболевания.

Материалы и методы. Характеристика выборки. В исследование включены 457 пациентов с подтвержденным гистологическим диагнозом РП и 474 здоровых индивида без РП. Все обследованные были пациентами клиники Башкирского государственного медицинского университета, Уфа. Забор образцов крови проводился сотрудниками кафедры урологии. Пациенты и контрольные группы были добровольцами, и письменное информированное согласие получено от каждого участника, ответившего на вопросник. Исследование одобрено биоэтическим комитетом Института биохимии и генетики УФИЦ РАН. В исследуемой группе 33,4% пациентов имели начальные стадии заболевания (I–II стадии злокачественного процесса, согласно TNM классификации) и 66,6% пациентов – поздние стадии (III–IV стадии злокачественного процесса, согласно классификации TNM). Степень дифференцировки опухоли простаты проводилась по шкале Глисона. Сумма баллов по Глисону менее 8 баллов – 80,8% пациентов, более 8 – 19,25%. Возраст пациентов варьировался от 44 до 89 лет.

Выделение геномной ДНК. При выполнении молекулярногенетического исследования использовались образцы ДНК из лимфоцитов периферической венозной крови. Крoвь набирали в вакуумные пробирки с К3 ЭДТА (этилендиаминтетрауксусная кислота) в качестве антикoагулянта. Выделение ДНК проводили методом последовательной фенольно-хлороформной экстракции по Мэтью.

Генотипирование. В гене PTEN проведено генотипирование четырех SNP, выбранных из общедоступной базы данных одиночных нуклеотидов (rs2299941, rs1903858, rs10490920, rs2735343). Идентификация генотипов и аллелей изученных полиморфных локусов гена PTEN проводилась с использованием метода аллельной дискриминации TaqMan. Статистическая обработка полученных результатов проводилась с использованием таблицы сопряженности 2х2 (http://www.biometrica.tomsk.ru/freq_ New.htm).

Результаты и обсуждение. Проведенный нами анализ полиморфного локуса rs2735343 гена PTEN позволил выявить генотипы, ассоциированные с риском развития РП. При разделении больных по возрасту манифестации РП в группе больных с возрастом начала заболевания после 55 лет выявлено более частое носительство генотипа rs2735343*CG гена PTEN по сравнению с контрольной группой (42 и 21% соответственно) (p=0,009, OR=2,81, CI=1,25–6,30). Сравнительный анализ выборки больных РП с контрольной группой показал, что у пациентов с поздними стадиями заболевания статистически значимо чаще встречается генотип rs2735343*CG гена PTEN по сравнению с контрольной выборкой; данный генотип является рисковым в отношении развития РП тяжелого течения у жителей Республики Башкортостан (p=0,002, OR=2,05, 52% CI=1,31–3,22), в то время как генотип rs2735343*GG протективный в отношении развития заболевания тяжелого течения (p=0,004, OR=0,51, 52% CI=0,32–0,81). При сравнении частот генотипов изученного локуса гена PTEN в анализируемых нами группах с учетом градации по шкале Глисона выявлено, что носительство генотипа rs2735343*CG гена PTEN (p=0,02, OR=0,48, 38% CI=0,27–0,87) может быть протективным маркером в отношении развития РП, тогда как носительство гомозиготного генотипа rs2735343*GG гена PTEN (p=0,005, OR=2,44, 55% CI=1,33–4,46) – маркер риска развития заболевания. Распределение частот генотипов полиморфного локуса rs2735343 гена PTEN представлено в табл. 1.

61-1.jpg (201 KB)

Сравнительный анализ полиморфных локусов rs2299941, rs1903858, rs10490920 гена PTEN между группами больных РП и здоровых доноров из Республики Башкортостан статистически значимых различий не выявил. Частоты генотипов приведены в табл. 2.

61-2.jpg (194 KB)

С учетом важной роли, которую SNP играют в качестве генетических маркеров при различных типах заболеваний, выбран ген PTEN и SNP, которые являются кандидатами на восприимчивость к РП и влиянию на прогноз заболевания [20]. Компоненты сигнального пути PTEN/PI3K/AKT являются важным регулятором роста, метаболизма, клеточного цикла, репарации ДНК и ингибирования апоптоза [21]. Изученный здесь полиморфный вариант rs2735343 расположен в интронной области гена PTEN. Согласно Jang et al., он может влиять на сплайсинг, экспрессию белка, следовательно, регуляцию клеточного цикла и риск развития рака [22].

Наши результаты, добавленные к этим, предполагают, что определенные изменения в этом гене способны предсказывать риск развития РП, а также агрессивное течение заболевания.

Выводы. Данные, полученные в нашем исследовании, расширяют знания о генетических основах предрасположенности к РП. Идентификация и внедрение новых маркеров позволят улучшить прогнозирование поведения опухоли у пациентов с РП. Понятие о молекулярно-генетических маркерах предоставит возможность лечащему врачу индивидуализировать лечение в соответствии с генетическими характеристиками каждого пациента. Результаты нашего исследования указывают на возможную роль SNP rs2735343 гена PTEN как потенциального молекулярного маркера, использование которого возможно в комплексных прогностических панелях для диагностики РП, однако полученные данные нуждаются в дополнительном подтверждении перед применением в клинической практике. Тем не менее необходимо проводить дальнейшие исследования полиморфного локуса rs2735343 гена PTEN для установления функциональной значимости и роли в патогенезе рака простаты.

About the Authors

Corresponding author: M.V. Loginova – oncologist at the Department of Oncology of Antitumor drug therapy №2, Bashkir State Medical University of the Ministry of Health of the Russian Federation, Clinic of Bashkir State Medical University, Ufa, Russia, Ph.D. student at the Department of Urology with a course of postgraduate education of Bashkir State Medical University, Ufa, Russia, e-mail: mariialoginova25@ gmail.com

Similar Articles